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小贝战“疫”:当抗病毒药物筛选遇上自动化工作站

点击次数:269 发布时间:2020-02-21

       近日,我国研究人员评估了几种广谱抗病毒药物对新型冠状病毒SARS-Cov-2的抑制作用。1细胞实验发现,瑞德西韦和盐酸氯喹的半数有效浓度EC50分别为0.77 uM1.13 uM,选择系数SI分别大于12988。这表明它们在细胞水平能够有效抑制SARS-Cov-2的感染。

        


         
事实上一个抗病毒药物绝非朝夕炼成,需要经历体外实验、体内动物实验、临床试验的一系列研究历程,周期长、投入大、风险高。体外实验处于药物发现的早期,是非常重要的基石步骤。通过细胞模型对化合物的细胞毒性和病毒抑制能力进行筛选,能够定量地评价其有效性,也可以排除不必要的药物化学结构设计、筛选,或者后续体内实验的前期投入。

         类似于对瑞德西韦和盐酸氯喹的实验,测试现有的抗病毒药物对新型冠状病毒的药效,是对新型冠状病毒这样突发疫情的一条高效路径。同时,开展对大量先导化合物库的高通量筛选,也将是发展抗新型冠状病毒药物的重点工作。

         随着筛选通量和复杂程度的增加,自动化工作站已逐渐成为药物筛选的重要手段。Biomek自动化工作站可以有效地管理实验流,处理多类型、多进程的高通量实验。与传统的人工实验相比,Biomek工作站能够有效节省人力,标准化工作流,缩短研发周期,提高研发效率。








 
【自动化的抗病毒药物筛选方案

  绝不仅仅是移液

  无菌、振荡、温控、储存、孵育,全都可以有

  读板检测、在线离心、细胞计数、大体积分液,也都可以有

  我们还有

· 开放的仪器设计,轻松实现拓展整合

· 软件工具支持数据的采集、保存与溯源

· 工作流的时序优化,实现多进程、无人值守实验


· 
红外光幕自动感应防护,内置摄像头捕捉出错瞬间


(
此处插入短视频)

 

小贝的药筛方案可辅助完成:

· 高通量先导化合物初筛

· 化合物次级筛选

· 药物靶点量效关系

· 细胞实验

· 细胞培养

· 化合物库管理



参考
Biomek自动化工作站已经应用到抗菌化合物2SARS冠状病毒抑制物3,甲型流感病毒H3N2抑制物4等药物筛选。自动化实验和手工实验的IC50值高度一致。



1.  Wang M., Cao R., Zhang L. et al. Remdesivir and chloroquine effectively inhibit the recently emerged novel coronavirus (2019-nCoV) in vitro. Cell Res (2020). https://doi.org/10.1038/s41422-020-0282-0

2. Forry S. P., Madonna M. C., LópezPérez D. et al. Automation of antimicrobial activity screening. AMB Expr (2016) 6:20. DOI: 10.1186/s13568-016-0191-2

3. Severson W. E., Shindo N., Sosa M. et al. Development and Validation of a High-Throughput Screen for Inhibitors of SARS CoV and Its Application in Screening of a 100,000-Compound Library. Journal of Biomolecular Screening 12(1); 2007. DOI: 10.1177/1087057106296688

4. Severson W. E., Mcdowell M., Ananthan S. et al. High-Throughput Screening of a 100,000-Compound Library for Inhibitors of Influenza A Virus (H3N2). Journal of Biomolecular Screening 13(9); 2008 DOI: 10.1177/1087057108323123

 

*本文涉及的内容与产品仅用于科研和工业,不用于临床诊断。

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