您好,欢迎进入贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司网站!
一键分享网站到:
产品列表

—— PROUCTS LIST

技术文章Article 当前位置:首页 > 技术文章 > 液体处理专家如何自动化、标准化捕获测序文库制备

液体处理专家如何自动化、标准化捕获测序文库制备

点击次数:45 发布时间:2020-10-10

 

目标区域捕获测序技术,是根据已知特定基因组区域序列设计寡核苷酸探针,通过杂交将目标区域捕获富集进行二代测序。其针对目标区域深度测序,增加了检查灵敏度和准确性。既满足研究需求,又降低测序成本,在科研、临床中均备受关注。

 

液体处理专家贝克曼库尔特推出Biomek 自动化捕获测序方案,帮助您实现自动化、标准化的捕获测序。 由自动化工作站进行基因捕获,可以减少手工操作时间,提高工作效率,增加结果的重复性和均一性。 Biomek工作站可实现从核酸提取,文库构建,定量混样到捕获的整体实验流程。

 

Figure 1. 捕获测序文库构建自动化流程

 

由Biomek成功自动化的杂交捕获试剂盒:

 

   Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent

   Agilent SureSelect XT®

   Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input

   Illumina Nextera® Rapid Capture

   Illumina TruSeq® Exome

   Illumina TruSeq® Rapid Exome

   Illumina TruSight® Cancer

   Illumina TruSight® Tumor 15

   Illumina TruSight® Tumor 170

   IDT xGen® Exome Research Panel

   NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel

   Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS

 

Biomek自动化捕获测序数据展示

 

Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel试剂盒捕获测序文库制备。

 上图: 片段分析,其中主峰1和2为杂交捕获后cfDNA目标片段峰;

 下图:Qubit Fluorometric Quantification核酸定量结果。

Figure 3. IDT xGen®杂交捕获试剂盒历史手工数据vs. 

Biomek i7自动化工作站完成数据。A. 平均中靶率,B. 重复率,C. 覆盖度,D. GC偏移。

 

Biomek向导式软件操作界面

 

在软件操作界面上用户可以选择样本数量,是否使用台面整合的PCR仪,以及运行工作流程的哪个部分。此外,具备台面自动校对功能,当操作人员完成耗材摆放后,工作站可根据摄像头拍摄,自动判定耗材摆放是否正确,对错误摆放位置进行提示。避免由于人为摆放耗材错误,导致设备碰撞或试剂、时间损失。

 

Figure 4. 向导式软件操作,IDT xGen® 杂交捕获试剂盒方法选择界面。

 

Biomek自动化捕获测序——实践速度与通量的飞跃

 

Figure 5. 完成 24/48/96个样本的自动化IDT xGen®杂交捕获测序文库制备预估耗时。

 

版权所有 © 2020 贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司  ICP备案号:
QQ在线客服
电话咨询
  • 4001689057