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核酸片段分选?更准、更快的选择

点击次数:102 发布时间:2020-09-16

 

近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精|确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精|准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。

 

在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量的操作,使用普通磁珠无法准确做到片段大小的选择,而使用Agencourt SPRIselect的片段分选产品可以得到集中的核酸片段分布,并且可以完全自动化,广泛应用于:

 

   核酸片段回收

   核酸片段筛选

   NGS、Sanger测序

   qPCR、ddPCR等

 

Fig 1   Agencourt SPRIselect片段筛选试剂盒进行目标片段回收。

 

Agencourt SPRIselect试剂盒可常温保存,方便使用。支持高效纯化回收核酸片段(Fig 1);同时可根据SPRIselect磁珠与样品的比例选择性结合特定大小的核酸片段,工作流程易于调整且灵活,以快速达到去除小片段、大片段、或去大&去小的目的(Fig 2A)。SPRIselect磁珠优先结合大片段核酸,随着磁珠与样本体积比例增加,磁珠结合更小片段的效率增加,结合更大片段的效率降低。由此,操作人员可以自由选择需要筛选的片段范围,以满足不同核酸长度范围的应用需求(Fig 2B)。

 

Fig 2 (A) Agencourt SPRIselect片段筛选试剂盒进行去除小片段、去除大片段、及目标片段选择回收。

 

(B)M: 2100检测Marker;Shear: 弥散的DNA|片段;0.XX - 0.XX: 片段分选时去大、去小的磁珠样本比例。

 

高通量 、简便操作

 

基于Agencourt SPRIselect试剂盒的核酸回收和片段选择方法,贝克曼的Biomek自动化移液站可在1小时内完成96个样本的全自动流程,提供包含成熟的自动化方法、稳定的试剂、开放的耗材等在内的核酸回收和片段选择体系。

 

如果需要不同片段范围的文库,用户可以选择在多孔反应板中应用多种样品比率。Biomek自动化移液站的灵活八通道加样器可用于转移不同体积SPRIselect磁珠和样本,而多通道加样器可用于快速批量去除上清液、乙醇并转移最终洗脱的核酸等。

 

 

Fig 3 Agencourt SPRIselect 自动化核酸回收、选择操作系统

 

贝克曼库尔特为您提供不同规格Agencourt SPRIselect片段筛选试剂盒和使用支持,致力于为用户提供更加完整的解决方案。欲了解更多信息,请访问贝克曼库尔特网站、小贝智选网上商城或联系我们。

 

 

 

参考:

1.   US Patent 6938987

2.   US Patent 6938995

3.   

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