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如何应对细胞株系开发数据挑战

点击次数:109 发布时间:2020-10-23

 

细胞株开发是众多具有重大数据挑战的工作流程之一。与任何筛选过程一样,样本通量带来了数据量的挑战。当使用多种分析工具以不同格式生成不同类型的数据时,这就变得更加具有挑战性。这不仅需要在不同的孔板和孔之间移动数据,而且整个过程可能会延长数月。在整个过程中,必须对数据进行追踪,以确保进入生产的任何细胞株都有必要的历史数据(例如单克隆性的证明),并且为了报告需要,所有的数据都可以被方便地访问。在这里,我们将描述在Biomek i7工作站(图1)上自动化细胞株开发如何克服与此工作流程相关的许多数据挑战。

 

图1:Biomek i7工作站与三方设备整合一起被用于自动化细胞株开发工作流程。

 

作为液体转移步骤的一部分,Biomek软件会自动移动数据,因此数据可以随着样本移动而并行移动(图4)。同时,数据也可以存储在DART数据库中,未来任何时候扫描孔板条码时,相应的数据都会被自动检索出来。DART提供了不同时间交互的方法之间的链接(图4)——在诸如细胞株开发这样的长时间工作流程中,这是一个关键组件。

 

图3:自动化数据处理示意图。

 

除开存储和利用数据,DART数据库可以通过多种方便的方式访问。为了以用户友好的方式进行快速可视化,可通过Chrome浏览器直接实时查看(图6A),同时可以使用DART报告生成器在Excel中生成报告。

 

图6:DART数据查看和报告。

 

在任何实验中产生的数据使实验有价值。数据处理中的任何错误都可能消除这个价值,甚至可能将研究进程推向错误的方向。对于像细胞株开发这样长达数月的工作流程,数据丢失或错误的风险更大,因此,确保数据完整性的工具至关重要。Biomek和DART软件通过使数据完整性过程自动化且易于获取,可以为细胞株开发过程提供真正的价值。

 

想要了解更多关于数据处理方面的内容,请点击下图访问贝克曼库尔特生命科学部官|网

 

 

*以上内容涉及设备仅适用于科研和工业,不用于临床诊断。

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